A gestão atual da Rede de Plataformas Tecnológicas Fiocruz, conta com a direção geral do Vice-presidente de Pesquisa e Coleções Biológicas, e as seguintes instâncias de gestão:
A equipe é designada pelo Vice-presidente de Pesquisa e Coleções Biológicas e é composta pelo coordenador, gerentes executiva e operacional. À coordenação compete revisar periodicamente e cumprir as determinações constantes no documento de Normas Gerais de Utilização, consolidar e analisar o orçamento da Rede levando em conta as previsões de todas as subunidades, preparar os relatórios e apresentações para a CT de Pesquisa e para o Vice-presidente, com informações como produtividade, taxa de ocupação das plataformas e da Rede, número de solicitações e análises. Deve propor ações de melhoria, zelar pela qualidade dos serviços prestados pela Rede, monitorar o uso das plataformas pelo site, implementar melhorias propostas pela Comissão de Usuários, promover a integração das subunidades, atuar como facilitador para a Gestão da Qualidade nas Plataformas e manter o alinhamento das políticas da Rede com as direções das Unidades da Fiocruz.
Os Comitês são estabelecidos pelas Unidades da Fiocruz seguindo as diretrizes definidas no documento de Normas Gerais de Utilização e nos documentos da própria Unidade. Cabe aos Comitês cumprir e fazer cumprir as determinações destas diretrizes, atuar como interlocutor da Unidade e zelar pelos interesses dos usuários das subunidades de plataformas, propor ações de melhorias, contribuir na elaboração da previsão do orçamento das subunidades de Plataformas, discutir propostas e elaborar parecer sobre o orçamento, inclusão e/ou exclusão de subunidades para a direção da unidade, analisar e emitir parecer sobre a execução financeira dos recursos orçados e aprovados.
São pesquisadores da Fiocruz, especialistas nas tecnologias e análises da Plataforma, e que dão suporte no planejamento, implantação e operação das mesmas, assegurando a sua qualidade técnica e atualização das tecnologias.
São profissionais que gerenciem o dia-dia da operação da plataforma e sua manutenção, que interagem com os usuários, com o sistema de gerenciamento on-line da plataforma, com a coordenação da Rede e a diretoria da Unidade
São tecnologistas e técnicos que operam os equipamentos da Plataforma, executam as análises e/ou dão suporte para os usuários.